Отделение челюстно-лицевой хирургии функционирует с 1966 года. На сегодняшний день в отделении проводятся все современные зубосохраняющие операции, в том числе с использованием собственных разработок СамГМУ. На базе отделения ведется практическая работа кафедры челюстно-лицевой хирургии и стоматологии СамГМУ.

Сотрудниками отделения выполняются сложныекак экстренные, так и плановые операции: вскрытие флегмон и абсцессов различной локализации, удаление доброкачественных новообразований, различные реконструктивные, зубосохраняющие операции. Особое место занимают операции, проводимые на костях челюстно-лицевой области, включая посттравматические и врождённые деформации лицевого скелета.

Направления работы отделения:

• Травматология челюстно-лицевой области.
  С целью фиксации отломков используются индивидуальные накостные мини-пластины, изготавливаемые в межвузовском центре на базе СамГТУ, организованом при непосредственном участии сотрудников кафедры.

• Гнатическая хирургия.
• Микрохирургия лица.
• Применение клеточных технологий в челюстно-лицевой хирургии (разработаны и внедрены в клиническую практику биоинженерные конструкции).
• Эктопротезирование утраченных частей лица (с фиксацией на челюстных имплантатах).
• Дентальная имплантация (сотрудниками кафедры разработаны дентальные имплантаты, на которые получено разрешение на серийный выпуск). 
• Научные исследования и работа со специалистами других кафедр позволили внедрить новые методы лечения больных с обширными гемангиомами челюстно-лицевой области и деформациями прикуса, дефектами челюстей после онкологических заболеваний

Клиническая база отделения рассчитана на 40 коек.
При отделении работает лечебный терапевтический кабинет, где осуществляется лечение и происходит подготовка зубов к операциям.

Курирует работу отделения заведующий кафедрой челюстно-лицевой хирургии, заслуженный работник высшей школы РФ, член — корреспондент РАН, д.м.н., профессор Байриков Иван Михайлович. В современной челюстно-лицевой хирургии используются материалы и имплантаты, разработанные сотрудниками кафедры под его непосредственным руководством.

Амбулаторные стоматологические услуги:

• зубосохраняющие операции;
• удаление зубов любой сложности, в том числе так называемых зубов «мудрости» (удаление возможно, как под местной анестезией, так и под внутривенным наркозом);
• удаление доброкачественных новообразований на лице и слизистой оболочке полости рта;
• дентальная имплантация;
• костная пластика (открытый и закрытый синус-лифтинг, увеличение высоты или ширины альвеолярного отростка);
• лечение зубов, в том числе и эндодонтическое, с востановлением коронковой части современными материалами под общим обезболиванием; 
• удаление и лечение зубов пациентам с отягощённым общесоматическим и аллергологическим анамнезом, а также непереносимостью местных анестетиков.

Услуги, оказываемые в условиях стационара отделения челюстно-лицевой хирургии:

• ортогнатические операции при врождённых аномалиях прикуса у взрослых, совместно с врачами стоматологами-ортодонтами;
• лечение переломов костей лицевого скелета с использованием современных методов остеосинтеза;
• удаление опухолей слюнных желез с сохранением ветвей лицевого нерва;
• костная пластика нижней челюсти с использованием аутотрансплантатов;
• удаление доброкачественных образований челюстно-лицевой области с одномоментным восстановлением тканей биоинженерной конструкцией;
• реостеосинтез мыщелкового отростка нижней челюсти, при неправильном сращении;
• остеотомия и остеосинтез при неправильно сросшихся переломах нижней челюсти;
• остеотомия и остеосинтез при неправильно сросшихся переломах верхней челюсти;
• пластика при рубцовых деформациях мягких тканей лица;
• частичная резекция верхней челюсти с одномоментным замещением дефекта;
• частичная резекция нижней челюсти с одномоментной костной пластикой;
• устранение дефектов средней зоны лица, в том числе тотального дефекта носа;
• остеопластика с одномоментной дентальной имплантацией;
• подготовка протезного ложа для изготовления эндо- и экзопротезов;
• удаление гемангиомы лица с использованием метода эмболизации сосудов и лазерной техники;
• устранение посттравматической деформации средней зоны лица, нижней челюсти, стенок орбиты;
• лечение одонтогенных воспалительных процессов околоносовых пазух.